46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1799 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  85.85 
 
 		 212 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  84.91 
 
 		 212 aa  387  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  68.25 
 
 		 211 aa  324  8.000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 214 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  44.44 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  39.39 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  36.94 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  31.34 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  28.28 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  24.49 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  24.49 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  30.32 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  23.98 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  32.89 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  28.07 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  27.33 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  29.68 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  24.37 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  30.26 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  28.03 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1300  hypothetical protein  34.09 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  26.76 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  28.68 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  29.46 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  24.82 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  23.5 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  25.17 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  21.67 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  25.86 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  26.96 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  27.19 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.69 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  29.85 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  27.13 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  27.08 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  25.29 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  28 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  25.64 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>