49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004180 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  97.17 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  85.85 
 
 		 222 aa  391  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  72.6 
 
 		 211 aa  329  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  44.39 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  42.86 
 
 		 254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  39.39 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  35.9 
 
 		 246 aa  98.6  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  36.02 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  31.01 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  24.37 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  24.37 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  23.86 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  32.21 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  27.33 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  28.1 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1300  hypothetical protein  34.11 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  23.86 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  27.87 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  29.3 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  28.07 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  27.32 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  28.95 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  23.84 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 276 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  29.46 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  26.28 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  32.11 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  27.97 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  24.04 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  24.28 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  26.79 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  31.62 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  27.01 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  28.17 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  28.95 
 
 		 342 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.46 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  25.22 
 
 		 254 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  29.69 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  25.15 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0953  hypothetical protein  22.92 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000058701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  26.85 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  29.6 
 
 		 184 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0116  hypothetical protein  29.89 
 
 		 325 aa  42  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.105811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>