33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1731 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  60.58 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  47.78 
 
 
204 aa  160  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  44.97 
 
 
265 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  30.77 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  33.61 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  30.89 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  33.74 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  35.53 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.22 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  25.26 
 
 
186 aa  61.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  30.65 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  32.74 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  35.58 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  26.71 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  30.51 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  34.43 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  32.74 
 
 
313 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  34.51 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  27.5 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  34.48 
 
 
313 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  27.5 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  26.88 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  28.7 
 
 
260 aa  49.3  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  26.88 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  27.03 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  26.14 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  29.03 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  26.76 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  22.11 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  27.72 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  23.85 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>