51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3696 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
165 aa  340  5e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3695  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.71 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.05 
 
 
280 aa  58.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.93 
 
 
306 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2880  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.61 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248233  normal  0.229872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3890  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 
1089 aa  50.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.19 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.06 
 
 
306 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  43.66 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
232 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  42.65 
 
 
285 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  40.91 
 
 
423 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.51 
 
 
531 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.03 
 
 
554 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.88 
 
 
322 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.36 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.76 
 
 
319 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.27 
 
 
372 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  41.43 
 
 
292 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.58 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.62 
 
 
391 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.9 
 
 
433 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 
198 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.79 
 
 
245 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
300 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.91 
 
 
326 aa  44.3  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  41.27 
 
 
254 aa  44.3  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.02 
 
 
268 aa  44.3  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
128 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.03 
 
 
242 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.88 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.9 
 
 
288 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.91 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 
974 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.42 
 
 
792 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.31 
 
 
762 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  36.11 
 
 
228 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  32.1 
 
 
239 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.62 
 
 
294 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.52 
 
 
283 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.21 
 
 
283 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  40.3 
 
 
462 aa  40.8  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  36.36 
 
 
349 aa  40.8  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 
163 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  36.99 
 
 
229 aa  40.8  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.5 
 
 
266 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 
321 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.98 
 
 
327 aa  40.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>