30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3890 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3890  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3695  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.55 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.56 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2880  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.45 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248233  normal  0.229872 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.93 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.63 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  46.88 
 
 		 276 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 1089 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.02 
 
 		 259 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.02 
 
 		 259 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.02 
 
 		 259 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.9 
 
 		 253 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.76 
 
 		 280 aa  44.3  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  45.57 
 
 		 247 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.9 
 
 		 253 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.9 
 
 		 253 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  43.9 
 
 		 253 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.9 
 
 		 253 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  43.9 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  41.86 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.62 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.48 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.65 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 260 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.1 
 
 		 447 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.67 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  42.86 
 
 		 224 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.36 
 
 		 330 aa  40.8  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>