33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0311 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
360 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.77 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.65 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.21 
 
 
508 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.26 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.55 
 
 
762 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.56 
 
 
270 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.53 
 
 
587 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  35.29 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  51.56 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.14 
 
 
160 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.47 
 
 
485 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.67 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.52 
 
 
266 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.55 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.96 
 
 
206 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.4 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  40.62 
 
 
234 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.05 
 
 
575 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  44.44 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.14 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.826004  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.85 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.05 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.93 
 
 
249 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6806  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.46 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.94 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.19 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  46.15 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40.79 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.17 
 
 
549 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.82 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.65 
 
 
412 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>