25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0540 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2280  hypothetical protein  48.13 
 
 		 234 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  33.79 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  34.68 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  33.61 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  35.35 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  33.88 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  32.23 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  34.78 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  34.44 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  34.44 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  30.63 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  35.11 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.33 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  31.78 
 
 		 682 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  31.48 
 
 		 227 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  28.73 
 
 		 1048 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  31.78 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  24.81 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  34.58 
 
 		 291 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  29.29 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  29.29 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  28.69 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 767 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>