93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0432 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 421 aa  826    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  72.6 
 
 		 425 aa  511  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  46.52 
 
 		 282 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  49.47 
 
 		 252 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  49.47 
 
 		 252 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  49.47 
 
 		 252 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.44 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.34 
 
 		 252 aa  177  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.44 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  52.05 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  44.66 
 
 		 241 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.11 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  44.02 
 
 		 242 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  44.02 
 
 		 242 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  44.39 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  55.78 
 
 		 298 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  42.06 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.13 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  46.11 
 
 		 249 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  44.17 
 
 		 212 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  47.9 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  45.21 
 
 		 242 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  49.38 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.31 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.53 
 
 		 815 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  52.35 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.45 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.78 
 
 		 662 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  45.95 
 
 		 243 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.44 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  50.69 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  42.77 
 
 		 249 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  43.79 
 
 		 275 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  43.2 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  44.71 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  39.05 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  42.17 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  42.17 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  42.17 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  43.53 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  39.64 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  43.79 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  36.18 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  35.63 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.23 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  33.57 
 
 		 844 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  48.68 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.77 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  31.65 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  32.86 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  41.77 
 
 		 906 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  26.26 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  28.29 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  31.52 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  30.25 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  34.18 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  26.8 
 
 		 349 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.92 
 
 		 355 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  42.37 
 
 		 682 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  30.29 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  29.01 
 
 		 331 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  30 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.44 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.71 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  46.51 
 
 		 541 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  38.54 
 
 		 334 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  26.79 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 176 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.23 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  34.41 
 
 		 290 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  30.77 
 
 		 351 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 374 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  30.43 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  28.16 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  27.62 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  40.86 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  36.46 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  32.98 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  37.97 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  30.4 
 
 		 720 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  29.77 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  29.77 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  28.87 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2958  lytic murein transglycosylase  28.99 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  28.99 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.76 
 
 		 299 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  28.92 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  30.53 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  29.37 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  27.78 
 
 		 253 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>