More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5530 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5530  NLP/P60 protein  100 
 
 		 491 aa  991    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.479781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.6 
 
 		 390 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  29.7 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.46 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  46.1 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.53 
 
 		 331 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  41.5 
 
 		 340 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  43.61 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  43.94 
 
 		 160 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 162 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  28.27 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  41.55 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  39.04 
 
 		 394 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  26.15 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.3 
 
 		 235 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 236 aa  96.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 334 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 373 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 332 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.71 
 
 		 438 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.24 
 
 		 531 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  35.25 
 
 		 342 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 366 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.14 
 
 		 222 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  38.03 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  34.67 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.52 
 
 		 330 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  38.4 
 
 		 400 aa  86.7  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 501 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  40 
 
 		 345 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.61 
 
 		 321 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  34.33 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  28.06 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.82 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  33.09 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.82 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  33.82 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  38.74 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.69 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  36.3 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  36.3 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  34.03 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  36.3 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  38.74 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  36.3 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  36.3 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  36.3 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  31.76 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  29.5 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  28.53 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  30.05 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  30.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  30.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  30.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  30.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.07 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  30.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  36.59 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  30.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  30.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  30.05 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  33.51 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.94 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.36 
 
 		 176 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  29.68 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  37.27 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  30.73 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  29.58 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>