38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1286 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  100 
 
 
933 aa  1920    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  28.64 
 
 
390 aa  104  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.97 
 
 
574 aa  85.5  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  42.11 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.17 
 
 
655 aa  81.3  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  40.35 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  37.61 
 
 
303 aa  70.5  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  41.28 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  32.89 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  36.67 
 
 
266 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  40.59 
 
 
157 aa  65.1  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  36.67 
 
 
265 aa  65.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  36.67 
 
 
265 aa  65.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  38.39 
 
 
468 aa  64.3  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  32.37 
 
 
499 aa  61.6  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  35.29 
 
 
300 aa  59.3  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  35.29 
 
 
300 aa  59.3  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  37.25 
 
 
279 aa  59.3  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  36.7 
 
 
324 aa  58.9  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  37.25 
 
 
279 aa  59.3  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  35 
 
 
455 aa  58.9  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  36.7 
 
 
143 aa  58.9  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  33.03 
 
 
143 aa  58.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  33.03 
 
 
143 aa  58.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  56.2  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  31.54 
 
 
357 aa  55.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  33.33 
 
 
447 aa  54.7  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  36.17 
 
 
360 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  31.96 
 
 
156 aa  52.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  30.84 
 
 
358 aa  52.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  36.79 
 
 
318 aa  50.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  39.6 
 
 
166 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  39.6 
 
 
166 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  35.42 
 
 
397 aa  46.6  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  32.29 
 
 
582 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  33.66 
 
 
169 aa  45.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>