246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_04231 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  92.31 
 
 
286 aa  530  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  29.51 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  24.51 
 
 
314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  23.4 
 
 
337 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  25 
 
 
499 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.01 
 
 
470 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  34.19 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  27.45 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  32.08 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  32.08 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  32.08 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  32.08 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  32.08 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  32.08 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  32.08 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  32.08 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  36.94 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  31.13 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 
620 aa  66.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  28.1 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  27.87 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  27.43 
 
 
544 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.28 
 
 
1001 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 
405 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  31.43 
 
 
428 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  25.77 
 
 
587 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  30.56 
 
 
539 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  33.02 
 
 
1079 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  31.86 
 
 
514 aa  63.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  28.14 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  22.99 
 
 
547 aa  62.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  31.07 
 
 
602 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  25.14 
 
 
409 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  26.75 
 
 
495 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 
518 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  25.98 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  27.13 
 
 
515 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
1021 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  21.64 
 
 
445 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  25.77 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  29.45 
 
 
509 aa  59.3  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  26.6 
 
 
515 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  28.43 
 
 
250 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  26.98 
 
 
515 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  34 
 
 
515 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  34 
 
 
515 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.31 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  27.2 
 
 
849 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  34 
 
 
519 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  34 
 
 
515 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  25.97 
 
 
253 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  32.32 
 
 
173 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  30.65 
 
 
519 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  27.03 
 
 
519 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.45 
 
 
617 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  28.48 
 
 
571 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  28.47 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  23.58 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  26.06 
 
 
515 aa  56.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  29.49 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.89 
 
 
534 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08381  hypothetical protein  28.95 
 
 
141 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.275743  hitchhiker  0.00161407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  28.18 
 
 
445 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  23.3 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  30.77 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  29.52 
 
 
428 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  24.79 
 
 
453 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.91 
 
 
554 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  29.03 
 
 
466 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  30.51 
 
 
555 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  27.69 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  27.84 
 
 
440 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.57 
 
 
543 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  27.01 
 
 
634 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.67 
 
 
517 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  26.42 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  29.81 
 
 
419 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  29.2 
 
 
557 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  25.12 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  30.39 
 
 
517 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.35 
 
 
532 aa  52.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  28.32 
 
 
542 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  30.84 
 
 
442 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  40.62 
 
 
265 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.52 
 
 
406 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.52 
 
 
455 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.52 
 
 
406 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.52 
 
 
406 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  28.7 
 
 
328 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  23.86 
 
 
515 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  22.16 
 
 
612 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.99 
 
 
797 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  30.08 
 
 
467 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  32.52 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  31.78 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.14 
 
 
455 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  25 
 
 
498 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>