266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_03561 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  88.14 
 
 
253 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  74.31 
 
 
256 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  58.1 
 
 
253 aa  274  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  33.02 
 
 
287 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  23.28 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  23.83 
 
 
337 aa  89  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.58 
 
 
470 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  30.23 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  30.7 
 
 
499 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  36.15 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  34.55 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  35.64 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  30.48 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  30.07 
 
 
596 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.17 
 
 
568 aa  68.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  30.87 
 
 
661 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  27.1 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.1 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.93 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  26.21 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  36.7 
 
 
517 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.43 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  25.95 
 
 
445 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 
561 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.71 
 
 
518 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.03 
 
 
327 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  34.65 
 
 
522 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  25.98 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 
849 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.9 
 
 
517 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  32.48 
 
 
409 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  26.56 
 
 
544 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  34.58 
 
 
430 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.35 
 
 
552 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  34.58 
 
 
430 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  34.58 
 
 
430 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  34.58 
 
 
430 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  34.58 
 
 
430 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  34.58 
 
 
430 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  33.64 
 
 
430 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  33.64 
 
 
430 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 
733 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  27.93 
 
 
503 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  29.41 
 
 
426 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 
650 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  28.7 
 
 
338 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  30.4 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  27.93 
 
 
539 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 
570 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  28.93 
 
 
554 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  26.32 
 
 
524 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  31.43 
 
 
514 aa  58.9  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 
430 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  33.64 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  28.99 
 
 
487 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  27.03 
 
 
620 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  28.79 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.35 
 
 
543 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.99 
 
 
499 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  24.37 
 
 
556 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  28.3 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.89 
 
 
532 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.2 
 
 
527 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  28.3 
 
 
553 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 
430 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 
595 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  25.55 
 
 
542 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 
546 aa  56.6  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  26.97 
 
 
519 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  29.03 
 
 
515 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  24.3 
 
 
445 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  29.03 
 
 
515 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  29.91 
 
 
515 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  26.61 
 
 
394 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  29.03 
 
 
515 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  29.03 
 
 
519 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.85 
 
 
581 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  32.71 
 
 
518 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  29.7 
 
 
511 aa  55.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  32.14 
 
 
390 aa  55.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.29 
 
 
289 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  32.26 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  36.11 
 
 
419 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  29.85 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  31.01 
 
 
571 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  27.19 
 
 
563 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.66 
 
 
528 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  28.06 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  25.71 
 
 
560 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  29.85 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  31.73 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  31.73 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  28.41 
 
 
159 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.13 
 
 
546 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  27.14 
 
 
1556 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  28.97 
 
 
515 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 
390 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  29.91 
 
 
515 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>