237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0425 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 159 aa  300  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  81.25 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  56.67 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  45.38 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  51.06 
 
 		 788 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  28.41 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.33 
 
 		 433 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44 
 
 		 751 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  53.33 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  42.47 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 754 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  45.1 
 
 		 727 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  51.85 
 
 		 445 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  45.1 
 
 		 727 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  55.56 
 
 		 428 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 422 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  39.47 
 
 		 305 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  47.83 
 
 		 390 aa  52  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  29.82 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  44.21 
 
 		 202 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  43.48 
 
 		 310 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 590 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 466 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  44.23 
 
 		 447 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 414 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  53.7 
 
 		 307 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  35.79 
 
 		 438 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  41.05 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  39.06 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 427 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.01 
 
 		 470 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 500 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  48.98 
 
 		 530 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  44.12 
 
 		 261 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  33.73 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  46.94 
 
 		 534 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 583 aa  48.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  48.84 
 
 		 372 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 427 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  29.36 
 
 		 304 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 327 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  32.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  32.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  32.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  46.67 
 
 		 546 aa  47.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  32.91 
 
 		 251 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  32.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  36.84 
 
 		 314 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 204 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  43.33 
 
 		 509 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 530 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 250 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  46.67 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  44 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 522 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  59.09 
 
 		 509 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3521  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000216778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  44 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  30.56 
 
 		 253 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.3 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  37.78 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.28 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  40.74 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  40 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 544 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  51.06 
 
 		 367 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  39.34 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  48.84 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  45.65 
 
 		 587 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  44.23 
 
 		 397 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  47.73 
 
 		 320 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  34.85 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  35.44 
 
 		 315 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.78 
 
 		 274 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  32.91 
 
 		 250 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  44.9 
 
 		 1556 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  42 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  33.66 
 
 		 297 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.62 
 
 		 443 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  42 
 
 		 233 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  41.07 
 
 		 515 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5051  Peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  44.44 
 
 		 296 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  29.23 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  36.51 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  28.75 
 
 		 409 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  39.73 
 
 		 444 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  36.92 
 
 		 499 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42 
 
 		 233 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  46.51 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  41.07 
 
 		 519 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.44 
 
 		 236 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42 
 
 		 233 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>