168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5051 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5051  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 326 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3043  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.52 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  26.8 
 
 		 389 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  25.08 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  30.32 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  29.86 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6487  Peptidoglycan-binding LysM  26.7 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.577671  normal  0.707539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 527 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  27.59 
 
 		 466 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  30.71 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  30 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  27.07 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  29.58 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  26.19 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  28.97 
 
 		 849 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  28.48 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  30.5 
 
 		 483 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.62 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  28.81 
 
 		 556 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.53 
 
 		 637 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  24.75 
 
 		 528 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  29.29 
 
 		 560 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.82 
 
 		 593 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  29.79 
 
 		 483 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  30.68 
 
 		 495 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  26.43 
 
 		 583 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.82 
 
 		 631 aa  52.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  28.67 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  22.3 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  23.97 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  28.76 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  22.96 
 
 		 546 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  26.75 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  29.79 
 
 		 483 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  29.79 
 
 		 483 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.87 
 
 		 579 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  25.14 
 
 		 518 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  29.79 
 
 		 474 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  28.97 
 
 		 514 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  37.66 
 
 		 619 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.53 
 
 		 581 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.76 
 
 		 576 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.56 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 498 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  33.57 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  21.62 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  21.62 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  30.5 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.67 
 
 		 515 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 168 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  22.3 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  22.3 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  22.3 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  43.88 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  24.67 
 
 		 553 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  22.3 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  23.96 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  45.45 
 
 		 297 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  27.66 
 
 		 474 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.5 
 
 		 554 aa  49.7  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  25.17 
 
 		 571 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  44.19 
 
 		 562 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  27.37 
 
 		 168 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  22.91 
 
 		 550 aa  49.3  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.99 
 
 		 527 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  24.44 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26 
 
 		 534 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  33.81 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  27.74 
 
 		 511 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  30.07 
 
 		 471 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.27 
 
 		 532 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  20.27 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.08 
 
 		 597 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  22.92 
 
 		 479 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  24.49 
 
 		 661 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  27.08 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  44.59 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  48 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  21.62 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  23.97 
 
 		 503 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  24 
 
 		 544 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  30.83 
 
 		 590 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  25.12 
 
 		 515 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 447 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  23.9 
 
 		 651 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  23.97 
 
 		 448 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  24.38 
 
 		 539 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  34.44 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  25 
 
 		 515 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  23.49 
 
 		 179 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 530 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  34.44 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2729  peptidase M23B  40.35 
 
 		 389 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  26.16 
 
 		 534 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.21 
 
 		 840 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25 
 
 		 499 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  22.94 
 
 		 444 aa  46.2  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  32.53 
 
 		 412 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  24.31 
 
 		 384 aa  45.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>