204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_21400 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
500 aa  949    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  28.17 
 
 
530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  25.88 
 
 
522 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  23.12 
 
 
522 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  25.85 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  23.26 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  22.65 
 
 
536 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  21.85 
 
 
567 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21430  hypothetical protein  21.57 
 
 
418 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  17.74 
 
 
523 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  18.22 
 
 
520 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  18.02 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  25.16 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  18.22 
 
 
520 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  55.56 
 
 
788 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 
754 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  20.82 
 
 
511 aa  60.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.78 
 
 
409 aa  60.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  30.91 
 
 
526 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  43.55 
 
 
447 aa  56.6  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  42.25 
 
 
503 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  46.67 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 
262 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
187 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  52.17 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  52.17 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  52.17 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  52.17 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  52.17 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  52.17 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
466 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
430 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 
849 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
207 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  53.49 
 
 
274 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  50 
 
 
430 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  50 
 
 
430 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.86 
 
 
751 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.3 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  50 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  56.52 
 
 
183 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 
327 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.67 
 
 
192 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  51.85 
 
 
203 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  57.14 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  52.27 
 
 
620 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  31.17 
 
 
179 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.1 
 
 
274 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  34.78 
 
 
257 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 
128 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  39.13 
 
 
301 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  46.81 
 
 
279 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
168 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 
250 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  39.39 
 
 
290 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
341 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  52.17 
 
 
297 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
517 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  56.52 
 
 
202 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 
547 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 
286 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
423 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  39.19 
 
 
428 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  36 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  46.81 
 
 
587 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  47.83 
 
 
310 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  50 
 
 
271 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 
173 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  42.55 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 
191 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  48.89 
 
 
509 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  54.76 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.68 
 
 
470 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  37.88 
 
 
314 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  44.62 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
159 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  36 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  53.06 
 
 
233 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  44.62 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.15 
 
 
303 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2920  peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 
253 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  36.62 
 
 
546 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  34.67 
 
 
265 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  32.47 
 
 
446 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.78 
 
 
596 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  52.27 
 
 
560 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1083  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44 
 
 
506 aa  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.91418  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  50 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  46.81 
 
 
292 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  36.67 
 
 
583 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
519 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.93 
 
 
797 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  34.67 
 
 
265 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 
590 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  53.33 
 
 
251 aa  47.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  26.72 
 
 
253 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>