47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2836 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 583 aa  1105    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  34.44 
 
 		 179 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.67 
 
 		 2449 aa  78.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 		 173 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.64 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  42.42 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 156 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.7 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.32 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  27.69 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  33.16 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  27.81 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  30.53 
 
 		 279 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  56.82 
 
 		 210 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 536 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  34.67 
 
 		 297 aa  54.7  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.13 
 
 		 327 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 112 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 590 aa  50.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 		 168 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  48.89 
 
 		 271 aa  50.4  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5051  Peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 326 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  44.07 
 
 		 191 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.85 
 
 		 230 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  27.02 
 
 		 3692 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  23.22 
 
 		 698 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  40.58 
 
 		 159 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  52 
 
 		 346 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  28.72 
 
 		 3472 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  28.72 
 
 		 3471 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  46.67 
 
 		 271 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  28.74 
 
 		 384 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  39.39 
 
 		 788 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  44 
 
 		 3400 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  33.01 
 
 		 142 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.78 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  31.25 
 
 		 633 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  34.38 
 
 		 412 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  27.36 
 
 		 465 aa  44.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  40.24 
 
 		 1788 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  22.52 
 
 		 337 aa  44.3  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  32.47 
 
 		 207 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  28.39 
 
 		 619 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  29.82 
 
 		 291 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  24.62 
 
 		 556 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  29.82 
 
 		 292 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  29.82 
 
 		 294 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>