71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2106 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
509 aa  1006    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  27.43 
 
 
536 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  26.83 
 
 
545 aa  196  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  27.26 
 
 
567 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  25.91 
 
 
530 aa  144  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  25.84 
 
 
481 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  23.06 
 
 
500 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  20.79 
 
 
522 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  19.57 
 
 
522 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  19.56 
 
 
523 aa  90.9  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  21.93 
 
 
511 aa  82  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  22.85 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  21.86 
 
 
508 aa  68.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  21.8 
 
 
520 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  72.73 
 
 
179 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  65.22 
 
 
289 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  65.12 
 
 
156 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  59.18 
 
 
583 aa  60.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 
433 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3521  Peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
185 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000216778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 
221 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  56.82 
 
 
173 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  54.55 
 
 
112 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  48.89 
 
 
423 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  57.78 
 
 
191 aa  53.5  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 
307 aa  53.5  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.52 
 
 
230 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  52.38 
 
 
445 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.27 
 
 
327 aa  50.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  34.48 
 
 
262 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  53.66 
 
 
331 aa  50.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  26.6 
 
 
409 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 
420 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  35.63 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  40.82 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.65 
 
 
210 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 
503 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  59.09 
 
 
159 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  42.55 
 
 
271 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  59.09 
 
 
168 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  30.51 
 
 
289 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  30.43 
 
 
582 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  30.77 
 
 
651 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  52.08 
 
 
335 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  36.17 
 
 
301 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  43.18 
 
 
297 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  46.67 
 
 
546 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  43.48 
 
 
290 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  38.89 
 
 
271 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  40.43 
 
 
271 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.86 
 
 
75 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.92 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1086  rare lipoprotein A  42.55 
 
 
163 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.463128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  48.78 
 
 
332 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
301 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.64 
 
 
192 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  40.91 
 
 
283 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 
130 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  44.68 
 
 
304 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  41.46 
 
 
448 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.48 
 
 
341 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
128 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 
733 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2622  peptidoglycan-binding LysM:ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein  36.67 
 
 
322 aa  43.5  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0580662  normal  0.781551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1628  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.1 
 
 
317 aa  43.5  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494253  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 
183 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 
441 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2013  LysM/ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.1 
 
 
319 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  28.04 
 
 
447 aa  43.5  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  40.74 
 
 
515 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>