163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2843 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  56.86 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 500 aa  54.7  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 302 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  30.23 
 
 		 318 aa  52.4  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 327 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  52.27 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  52 
 
 		 310 aa  51.2  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  41.94 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  41.94 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  41.94 
 
 		 294 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  29.68 
 
 		 526 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  51.16 
 
 		 430 aa  50.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  29.81 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 590 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  46.15 
 
 		 412 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  54.35 
 
 		 399 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.86 
 
 		 576 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.83 
 
 		 470 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  50 
 
 		 394 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  26 
 
 		 290 aa  48.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  53.33 
 
 		 248 aa  48.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 445 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  52.27 
 
 		 401 aa  48.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  48.84 
 
 		 274 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  44.68 
 
 		 587 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  49.02 
 
 		 251 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  49.02 
 
 		 251 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  34.18 
 
 		 754 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  29.51 
 
 		 303 aa  47.8  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  40.3 
 
 		 290 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  44.68 
 
 		 788 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  49.02 
 
 		 251 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  49.02 
 
 		 250 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  49.02 
 
 		 251 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  52.27 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  52.27 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  52.27 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  50 
 
 		 751 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  31.4 
 
 		 727 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  38.16 
 
 		 344 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  31.4 
 
 		 727 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  52.27 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  49.02 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  52.27 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  46.67 
 
 		 420 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  40 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.45 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  43.4 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 422 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 507 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 447 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  48.98 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  47.73 
 
 		 503 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  38.6 
 
 		 465 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  44.23 
 
 		 428 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  43.18 
 
 		 412 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  48 
 
 		 372 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  48 
 
 		 372 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  43.4 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  48.98 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  46.94 
 
 		 345 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  43.4 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  48.98 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  50 
 
 		 238 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  52.38 
 
 		 429 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  52.27 
 
 		 390 aa  45.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  39.58 
 
 		 284 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  28.97 
 
 		 544 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  47.73 
 
 		 328 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  42.55 
 
 		 283 aa  45.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 443 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  29.79 
 
 		 1556 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  50 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  46.81 
 
 		 263 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  50 
 
 		 414 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  48.89 
 
 		 509 aa  45.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  50 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  46.94 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  50 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  46.94 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  42.22 
 
 		 520 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  50 
 
 		 363 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  48.94 
 
 		 530 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  46.94 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  41.18 
 
 		 328 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  50 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  50 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  56.1 
 
 		 239 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  50 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  50 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  50 
 
 		 363 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>