177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03621 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  58.5 
 
 		 256 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  58.1 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  55.73 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  31.28 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  22.78 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  23.26 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.42 
 
 		 568 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  29.53 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.08 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  34.91 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  28.3 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  32.41 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  30.77 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  25.47 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  25.37 
 
 		 620 aa  59.7  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 		 661 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  31.68 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  35.64 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  24.03 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  23.53 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  29.8 
 
 		 849 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.77 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  27.66 
 
 		 394 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  23.58 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.68 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.93 
 
 		 637 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  26.67 
 
 		 428 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.1 
 
 		 593 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08381  hypothetical protein  34.67 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.275743  hitchhiker  0.00161407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.1 
 
 		 631 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  32.26 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  29.9 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  32.08 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  32.08 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 544 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  25.78 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.61 
 
 		 801 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  30 
 
 		 390 aa  52.8  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 570 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  27.14 
 
 		 557 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.65 
 
 		 679 aa  52.8  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  32.98 
 
 		 650 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  32.82 
 
 		 561 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  45.61 
 
 		 465 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  33.33 
 
 		 419 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  25.17 
 
 		 560 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.89 
 
 		 518 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  28.44 
 
 		 542 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  29.09 
 
 		 509 aa  50.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  31.52 
 
 		 733 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  29.66 
 
 		 514 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  26.17 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  27.72 
 
 		 1556 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.69 
 
 		 543 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  30.48 
 
 		 546 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  48.78 
 
 		 430 aa  49.3  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  28.1 
 
 		 602 aa  49.3  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 399 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  34.04 
 
 		 501 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  22.64 
 
 		 173 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  27.27 
 
 		 563 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  27.88 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  20.61 
 
 		 466 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.6 
 
 		 464 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  30.21 
 
 		 547 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  25.96 
 
 		 546 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  26.21 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  24.21 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  21.93 
 
 		 448 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  32.41 
 
 		 571 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.72 
 
 		 455 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  32.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.18 
 
 		 452 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.72 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.72 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.18 
 
 		 452 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.18 
 
 		 452 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.72 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  28.18 
 
 		 452 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.18 
 
 		 452 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.18 
 
 		 452 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.18 
 
 		 406 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  21.74 
 
 		 539 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.24 
 
 		 429 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.18 
 
 		 406 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  34.02 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>