19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2088 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2088  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 355 aa  734    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.155991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2005  cell wall-associated hydrolase  93.43 
 
 		 137 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00133091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1259  peptidoglycan hydrolase  48.09 
 
 		 228 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0604  prophage LambdaSa1, lysin, putative  48 
 
 		 239 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.45234  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  44.9 
 
 		 589 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1837  prophage LambdaSa2, lysin, putative  36.84 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00322069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0864  peptidoglycan hydrolase  37.91 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939547  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  30.8 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0912  SPP1 family holin  45.83 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.265143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0930  SPP1 family holin  45.83 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1047  SPP1 family holin  38.36 
 
 		 79 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176598  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1648  prophage, holin  35.06 
 
 		 109 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  35 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  38.27 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  26.14 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1786  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  33.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  28.72 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>