More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0330 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  100 
 
 		 424 aa  839    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.8 
 
 		 554 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.68 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  43.48 
 
 		 431 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  37.63 
 
 		 344 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  40 
 
 		 378 aa  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  40.71 
 
 		 313 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  37.78 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  41.43 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  39.72 
 
 		 569 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  38.69 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.5 
 
 		 412 aa  86.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.66 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.42 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  37.43 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  37.96 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  38.66 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  38.66 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.66 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  38.66 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  38.3 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  33.7 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  38.66 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  33.7 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  39.34 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  39.34 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  36.87 
 
 		 247 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  31.88 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.72 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  36.15 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  35.81 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  36.67 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  38.36 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  39.86 
 
 		 682 aa  80.1  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  37.7 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  35.12 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  34.64 
 
 		 270 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  39.55 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  37.31 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  38.6 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  34.85 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  38.76 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  38.6 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  38.6 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  31.41 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  36.72 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  38.41 
 
 		 999 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  37.4 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  41.98 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.53 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  38.6 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  38.6 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  39.23 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  35.16 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  38.03 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  35.22 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  30.56 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  33.1 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  38.41 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  37.04 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  34.9 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  38.17 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  42.37 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  38.17 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  38.17 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  41.6 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  38.17 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  38.17 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.98 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  34.16 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  38.17 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  41.79 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.21 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  40.18 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.06 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  30.46 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  36.3 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  37.69 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  32.92 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  35.71 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  35.88 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.78 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  40.88 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  42.52 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  35.38 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  33.58 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  37.69 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  36.51 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  30.39 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  33.55 
 
 		 271 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  36.36 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  41.48 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  33.11 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  36.84 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  37.98 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.44 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  29.07 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.58 
 
 		 324 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  35.86 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  38.93 
 
 		 238 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>