More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1277 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  100 
 
 
431 aa  850    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.14 
 
 
554 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  49.61 
 
 
269 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  42 
 
 
547 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  45.26 
 
 
378 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  45.04 
 
 
283 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  42.96 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  43.75 
 
 
314 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  46.67 
 
 
348 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.6 
 
 
751 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  45.83 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  43.51 
 
 
468 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  47.54 
 
 
198 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  46.67 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  46.72 
 
 
198 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  39.23 
 
 
491 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.57 
 
 
727 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.57 
 
 
727 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  40.31 
 
 
270 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  45.16 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.22 
 
 
480 aa  88.2  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  43.31 
 
 
375 aa  87.8  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  43.51 
 
 
236 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  43.38 
 
 
346 aa  87  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  47.17 
 
 
452 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  43.51 
 
 
360 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  48.25 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  43.51 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  42.57 
 
 
272 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  43.51 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  41.73 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  43.7 
 
 
824 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.14 
 
 
741 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  47.71 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.9 
 
 
590 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  42.15 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  44.19 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  41.32 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  42.15 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  42.15 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  42.11 
 
 
517 aa  83.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  46.83 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  39.67 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  43.18 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  41.67 
 
 
669 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  42.98 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  46.32 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  45.71 
 
 
754 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  42.74 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  42.42 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  40.52 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  34.33 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.14 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  44.64 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  41.04 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  42.4 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  38.66 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.14 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  46.32 
 
 
474 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  44.27 
 
 
332 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.33 
 
 
503 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  40.3 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  37.61 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  41.38 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  40.3 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  41.04 
 
 
266 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  45 
 
 
271 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.35 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  47.79 
 
 
475 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  43.16 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  41.38 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  44.23 
 
 
582 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  45.26 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  42.48 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  36.84 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  44.14 
 
 
390 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  43.31 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.98 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  41.38 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  31.98 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  42.62 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.5 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  36.84 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  36.42 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  29.57 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  38.1 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.33 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  31.98 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  39.82 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  35.92 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  41.09 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  42.86 
 
 
195 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  46.39 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  36.84 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  36.84 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  38.1 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  38.58 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.76 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  42.07 
 
 
649 aa  77.8  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  31.48 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>