92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1078 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  100 
 
 		 907 aa  1808    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  30.14 
 
 		 911 aa  355  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  26.95 
 
 		 1510 aa  320  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  26.95 
 
 		 1510 aa  320  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.71 
 
 		 805 aa  239  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  24.63 
 
 		 759 aa  193  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1206 aa  157  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  37.89 
 
 		 647 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  29.34 
 
 		 725 aa  134  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  27.91 
 
 		 811 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  27.91 
 
 		 811 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  29.39 
 
 		 1137 aa  124  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  28.7 
 
 		 716 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  27.67 
 
 		 726 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  26.33 
 
 		 1155 aa  118  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  26.33 
 
 		 1155 aa  118  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  33.11 
 
 		 1311 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  33.11 
 
 		 1311 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5848  hypothetical protein  34.89 
 
 		 487 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.37 
 
 		 1297 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  23.32 
 
 		 874 aa  112  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0669  TMP repeat protein  34.89 
 
 		 403 aa  111  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2691  TMP repeat protein  35.45 
 
 		 403 aa  108  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3415  hypothetical protein  34.67 
 
 		 404 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3775  hypothetical protein  34.98 
 
 		 415 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3498  hypothetical protein  34.98 
 
 		 416 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3419  hypothetical protein  34.34 
 
 		 415 aa  104  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  25.55 
 
 		 737 aa  104  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.93 
 
 		 738 aa  102  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  23.31 
 
 		 807 aa  97.8  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1387  TMP repeat protein  33.33 
 
 		 404 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000359331 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  24.69 
 
 		 989 aa  94.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  24.69 
 
 		 989 aa  94.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  24.55 
 
 		 1347 aa  94.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  21.93 
 
 		 792 aa  88.2  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  22.74 
 
 		 1178 aa  88.2  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  22.26 
 
 		 1216 aa  87.4  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  22.33 
 
 		 805 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  23.33 
 
 		 1347 aa  84.3  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  23.21 
 
 		 2066 aa  81.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  23.21 
 
 		 2066 aa  81.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  22.22 
 
 		 721 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.6 
 
 		 1095 aa  77.4  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  22.95 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  21.93 
 
 		 1566 aa  73.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  24.81 
 
 		 824 aa  73.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  24.31 
 
 		 1995 aa  69.7  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  23.55 
 
 		 739 aa  69.3  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  23.55 
 
 		 739 aa  69.3  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  23.99 
 
 		 975 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  24.78 
 
 		 959 aa  66.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  22.29 
 
 		 1216 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.26 
 
 		 1092 aa  65.1  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.15 
 
 		 936 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  21.94 
 
 		 852 aa  61.2  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  21.07 
 
 		 841 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  21.07 
 
 		 841 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0287  hypothetical protein  29.78 
 
 		 565 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00035869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1303  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.73 
 
 		 1156 aa  58.9  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1687  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.73 
 
 		 1156 aa  58.9  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2263  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.73 
 
 		 1156 aa  58.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  23.42 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.22 
 
 		 1211 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.3 
 
 		 950 aa  57.4  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  21.03 
 
 		 871 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.84 
 
 		 1211 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  21.59 
 
 		 1211 aa  55.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0644  hypothetical protein  24.83 
 
 		 537 aa  54.7  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0395132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  27.13 
 
 		 887 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  20.9 
 
 		 936 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  20.16 
 
 		 786 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.45 
 
 		 877 aa  52.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2837  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1149 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00780437  hitchhiker  0.000194456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  19.82 
 
 		 1084 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  22.15 
 
 		 806 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  18.83 
 
 		 956 aa  50.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1284  hypothetical protein  21.4 
 
 		 637 aa  48.9  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000117205  decreased coverage  0.00000270892 
 
 
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  24.3 
 
 		 1346 aa  48.5  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  20.12 
 
 		 1276 aa  47.8  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  22.81 
 
 		 714 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.58 
 
 		 981 aa  48.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  17.71 
 
 		 767 aa  47.8  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  22.78 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0762  hypothetical protein  28.12 
 
 		 353 aa  46.6  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  26.61 
 
 		 1283 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.09 
 
 		 719 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  21.33 
 
 		 656 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  25 
 
 		 877 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  19.72 
 
 		 733 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  28.15 
 
 		 590 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  22.38 
 
 		 550 aa  45.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1288  hypothetical protein  18.92 
 
 		 1195 aa  44.3  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>