65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1844 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  100 
 
 
911 aa  1816    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  29.87 
 
 
907 aa  354  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  26.32 
 
 
1510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  26.32 
 
 
1510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  29.25 
 
 
759 aa  155  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  29.12 
 
 
1206 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  26.4 
 
 
647 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  25.41 
 
 
805 aa  108  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  32.34 
 
 
807 aa  107  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  31.09 
 
 
975 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  28.73 
 
 
721 aa  100  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.77 
 
 
738 aa  89  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  22.24 
 
 
1549 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  29.3 
 
 
811 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  29.3 
 
 
811 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  28.81 
 
 
725 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  29.3 
 
 
726 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  23.31 
 
 
1137 aa  69.7  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  26.03 
 
 
716 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  23.59 
 
 
1155 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  23.59 
 
 
1155 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  23.57 
 
 
1311 aa  64.3  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  23.57 
 
 
1311 aa  64.3  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  24.12 
 
 
989 aa  64.3  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  32.67 
 
 
199 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  24.12 
 
 
989 aa  64.3  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  26.54 
 
 
222 aa  63.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  25.79 
 
 
1216 aa  63.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  22.08 
 
 
2066 aa  62.4  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  22.08 
 
 
2066 aa  62.4  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  21.16 
 
 
1030 aa  58.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  23.66 
 
 
874 aa  58.2  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  23.65 
 
 
1566 aa  56.2  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  35.44 
 
 
1063 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  24.27 
 
 
1178 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  23.6 
 
 
1183 aa  51.6  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  27.27 
 
 
1161 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  51.06 
 
 
181 aa  50.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  51.06 
 
 
189 aa  50.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  27.98 
 
 
914 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3419  hypothetical protein  24.19 
 
 
415 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  22.75 
 
 
1183 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  25 
 
 
1077 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  35.87 
 
 
196 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.04 
 
 
805 aa  49.7  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  26.9 
 
 
217 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  20.9 
 
 
981 aa  48.9  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  29.38 
 
 
222 aa  48.5  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  21.28 
 
 
1070 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3775  hypothetical protein  23.72 
 
 
415 aa  47.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3498  hypothetical protein  23.72 
 
 
416 aa  47.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.18 
 
 
1297 aa  47  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3415  hypothetical protein  23.72 
 
 
404 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  23.47 
 
 
1183 aa  47  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  22.7 
 
 
1183 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  25.59 
 
 
1104 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  27.23 
 
 
1028 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2837  hypothetical protein  22.5 
 
 
1149 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00780437  hitchhiker  0.000194456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  48.84 
 
 
205 aa  44.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  27.23 
 
 
1028 aa  45.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  26.44 
 
 
1183 aa  44.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  26.32 
 
 
216 aa  44.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  32.95 
 
 
223 aa  44.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  26.44 
 
 
1183 aa  44.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  22.91 
 
 
1216 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>