63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0849 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 
738 aa  1470    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.8 
 
 
805 aa  250  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2263  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.83 
 
 
1156 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1687  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.83 
 
 
1156 aa  155  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1303  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.83 
 
 
1156 aa  155  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  30.23 
 
 
1347 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  30.25 
 
 
1347 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  25.41 
 
 
759 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  22.84 
 
 
907 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  25 
 
 
911 aa  97.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  22.95 
 
 
1084 aa  91.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  29.95 
 
 
647 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.79 
 
 
1297 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  20.81 
 
 
1549 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  21.58 
 
 
1510 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  21.58 
 
 
1510 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  21.62 
 
 
2066 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  21.62 
 
 
2066 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  27.38 
 
 
1178 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  28.83 
 
 
1346 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  27.8 
 
 
1283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  27.78 
 
 
1120 aa  56.6  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.66 
 
 
733 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  26.67 
 
 
1216 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  55.32 
 
 
1030 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  24.49 
 
 
814 aa  53.9  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  23.81 
 
 
805 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.01 
 
 
1173 aa  52  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  33.09 
 
 
739 aa  52  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.2 
 
 
950 aa  51.6  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  26.35 
 
 
721 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  22.13 
 
 
716 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  20.97 
 
 
874 aa  51.2  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  24.54 
 
 
1070 aa  50.8  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  30.1 
 
 
824 aa  50.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  22.56 
 
 
989 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  22.56 
 
 
989 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  27.7 
 
 
725 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.96 
 
 
1371 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  24.04 
 
 
739 aa  48.5  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  24.04 
 
 
739 aa  48.5  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  26.36 
 
 
666 aa  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  22.12 
 
 
1127 aa  47.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  22.31 
 
 
975 aa  47.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  29.76 
 
 
540 aa  47.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.92 
 
 
1245 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  22 
 
 
642 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  22.78 
 
 
877 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.15 
 
 
815 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  26.17 
 
 
811 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  22.75 
 
 
969 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  25 
 
 
1566 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.57 
 
 
877 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  26.17 
 
 
811 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  21.83 
 
 
1216 aa  45.8  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.07 
 
 
1032 aa  45.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  20.53 
 
 
680 aa  45.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.94 
 
 
760 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.53 
 
 
1671 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  26.41 
 
 
815 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.58 
 
 
959 aa  43.9  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  25.25 
 
 
726 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.58 
 
 
959 aa  43.9  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>