66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_C0004 on replicon NC_008265
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  100 
 
 		 1178 aa  2383    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.89 
 
 		 1092 aa  318  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  26.42 
 
 		 2066 aa  286  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  26.42 
 
 		 2066 aa  286  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  30.03 
 
 		 1549 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  35.81 
 
 		 1127 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  37.92 
 
 		 975 aa  227  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  33.42 
 
 		 1297 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.76 
 
 		 1671 aa  184  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  26.02 
 
 		 1183 aa  182  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  26.14 
 
 		 1183 aa  180  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  26.47 
 
 		 1183 aa  179  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  29.36 
 
 		 1216 aa  178  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.4 
 
 		 959 aa  177  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.4 
 
 		 959 aa  177  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  23.02 
 
 		 1346 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  26.54 
 
 		 1183 aa  174  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  25.7 
 
 		 1183 aa  172  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  25.79 
 
 		 1183 aa  171  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  25.47 
 
 		 1183 aa  160  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  21.83 
 
 		 1283 aa  151  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.35 
 
 		 877 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  29.31 
 
 		 971 aa  137  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.14 
 
 		 733 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  26.89 
 
 		 971 aa  127  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  27.09 
 
 		 969 aa  126  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  30.47 
 
 		 914 aa  121  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.24 
 
 		 1173 aa  115  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  23.26 
 
 		 815 aa  112  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.96 
 
 		 1371 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.97 
 
 		 1343 aa  108  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  26.39 
 
 		 757 aa  107  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.09 
 
 		 815 aa  106  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.45 
 
 		 1478 aa  107  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  24.65 
 
 		 987 aa  104  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  25.92 
 
 		 809 aa  97.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  25.62 
 
 		 813 aa  97.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.35 
 
 		 981 aa  93.2  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  26.5 
 
 		 759 aa  91.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  23.4 
 
 		 1510 aa  90.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  23.4 
 
 		 1510 aa  90.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  22.74 
 
 		 907 aa  89.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.14 
 
 		 936 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.96 
 
 		 936 aa  84  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  28.45 
 
 		 921 aa  82  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.76 
 
 		 805 aa  81.3  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1303  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.06 
 
 		 1156 aa  80.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1687  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.06 
 
 		 1156 aa  80.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2263  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.06 
 
 		 1156 aa  80.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  22.34 
 
 		 1084 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  25 
 
 		 459 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  27.6 
 
 		 1409 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.76 
 
 		 738 aa  64.3  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.99 
 
 		 1095 aa  63.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.75 
 
 		 733 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  26.03 
 
 		 759 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.37 
 
 		 1245 aa  55.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  22.15 
 
 		 1120 aa  52.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0709  TP901 family phage tail tape measure protein  22.92 
 
 		 709 aa  52.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  21.02 
 
 		 1660 aa  52  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  31.18 
 
 		 647 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2149  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  22.22 
 
 		 356 aa  49.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  23.08 
 
 		 684 aa  46.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  23.08 
 
 		 684 aa  46.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  19.96 
 
 		 1736 aa  45.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>