60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1215 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1030 aa  2085    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.42 
 
 		 959 aa  154  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  24.82 
 
 		 1660 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.03 
 
 		 1032 aa  140  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4360  Phage-related minor tail protein-like  35.43 
 
 		 1206 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348966  normal  0.27157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  27.04 
 
 		 877 aa  101  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1206 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3484  putative tail protein from prophage; putative tail length tape measure motif protein  30.3 
 
 		 409 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0174075  hitchhiker  0.00423679 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  28.35 
 
 		 814 aa  89.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.01 
 
 		 877 aa  79.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  22.32 
 
 		 739 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  34.04 
 
 		 1183 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  34.03 
 
 		 1183 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  34.03 
 
 		 1183 aa  69.7  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5848  hypothetical protein  24.02 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  33.33 
 
 		 1183 aa  67  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  27.08 
 
 		 986 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  32.62 
 
 		 1183 aa  65.1  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  31.91 
 
 		 1183 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.19 
 
 		 825 aa  63.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  22.33 
 
 		 739 aa  63.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  22.33 
 
 		 739 aa  63.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  20.96 
 
 		 1311 aa  63.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  20.96 
 
 		 1311 aa  63.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.65 
 
 		 817 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.72 
 
 		 743 aa  58.9  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  26.74 
 
 		 935 aa  58.9  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  21.39 
 
 		 911 aa  58.2  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  26.16 
 
 		 935 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  21.63 
 
 		 877 aa  55.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  26.09 
 
 		 656 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  25 
 
 		 784 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  33.87 
 
 		 945 aa  53.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  33.87 
 
 		 945 aa  53.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  25.73 
 
 		 863 aa  53.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  31.49 
 
 		 647 aa  51.6  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  26.16 
 
 		 656 aa  51.6  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3667  hypothetical protein  37.11 
 
 		 191 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  27.78 
 
 		 971 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  23.79 
 
 		 1025 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0910  TP901 family phage tail tape measure protein  26.48 
 
 		 658 aa  49.3  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545562  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  24.33 
 
 		 784 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  32.32 
 
 		 1216 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  27.78 
 
 		 971 aa  48.9  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1070 aa  48.9  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  26.95 
 
 		 813 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  27.45 
 
 		 781 aa  48.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  25 
 
 		 784 aa  48.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  31.82 
 
 		 805 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  29.86 
 
 		 582 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  29.41 
 
 		 811 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.42 
 
 		 1478 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.09 
 
 		 760 aa  47.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  29.41 
 
 		 811 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  37.88 
 
 		 540 aa  46.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  30.77 
 
 		 605 aa  46.2  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  19.96 
 
 		 993 aa  45.8  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  27.1 
 
 		 887 aa  45.8  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  23.32 
 
 		 1025 aa  45.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  30.84 
 
 		 759 aa  44.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>