59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2914 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  100 
 
 		 993 aa  1938    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  31.06 
 
 		 784 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  31.06 
 
 		 784 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  31.23 
 
 		 784 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.08 
 
 		 743 aa  214  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  32.18 
 
 		 781 aa  204  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.27 
 
 		 817 aa  198  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  32.06 
 
 		 814 aa  195  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.13 
 
 		 950 aa  192  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  31.45 
 
 		 814 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  33.41 
 
 		 666 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.06 
 
 		 825 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  29.54 
 
 		 916 aa  174  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  27.87 
 
 		 1089 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  28.62 
 
 		 1314 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.63 
 
 		 823 aa  151  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1528  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.42 
 
 		 625 aa  126  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1557  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.82 
 
 		 722 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  26.42 
 
 		 739 aa  110  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  26.42 
 
 		 739 aa  110  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  32.87 
 
 		 599 aa  106  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  25.45 
 
 		 739 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  24.51 
 
 		 735 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  37.93 
 
 		 887 aa  99  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0743  hypothetical protein  33.19 
 
 		 646 aa  90.9  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.98 
 
 		 877 aa  88.6  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  22.36 
 
 		 680 aa  88.2  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  35.04 
 
 		 877 aa  81.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  28.98 
 
 		 902 aa  79  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  33.33 
 
 		 550 aa  76.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  35.67 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  29.67 
 
 		 919 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  29.82 
 
 		 920 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  38.35 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  28.85 
 
 		 1297 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  28.72 
 
 		 1078 aa  66.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  30.32 
 
 		 956 aa  65.1  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  22.53 
 
 		 651 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  22.52 
 
 		 1030 aa  62.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  26.67 
 
 		 1216 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  35.44 
 
 		 986 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  21.1 
 
 		 997 aa  58.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.98 
 
 		 1032 aa  57  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.17 
 
 		 959 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  50 
 
 		 540 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.06 
 
 		 719 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  31.51 
 
 		 775 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  28.31 
 
 		 1025 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  24.84 
 
 		 714 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  34.62 
 
 		 762 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  30.09 
 
 		 877 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  34.78 
 
 		 701 aa  48.9  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  28.04 
 
 		 1025 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  32.86 
 
 		 863 aa  48.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  36.11 
 
 		 1084 aa  48.1  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  29.85 
 
 		 738 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1952  hypothetical protein  31.03 
 
 		 697 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1089 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  26.67 
 
 		 647 aa  45.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>