53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3313 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 863 aa  1716    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  47.91 
 
 		 1078 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  39.54 
 
 		 877 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  46.74 
 
 		 596 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  35.92 
 
 		 945 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  35.92 
 
 		 945 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  28.87 
 
 		 920 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.36 
 
 		 877 aa  225  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  29.49 
 
 		 986 aa  161  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  26.63 
 
 		 956 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  32.77 
 
 		 887 aa  149  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  25.78 
 
 		 935 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.82 
 
 		 733 aa  147  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  25.93 
 
 		 935 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  37.88 
 
 		 919 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  26.3 
 
 		 971 aa  123  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  24.85 
 
 		 1025 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  25.97 
 
 		 1025 aa  114  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  25.97 
 
 		 971 aa  111  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  26.29 
 
 		 1025 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  33.9 
 
 		 815 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  33.33 
 
 		 809 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.9 
 
 		 815 aa  97.8  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  34.52 
 
 		 1216 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  33.33 
 
 		 813 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  33.9 
 
 		 361 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  25.94 
 
 		 550 aa  80.5  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  32.81 
 
 		 1183 aa  71.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  25.59 
 
 		 1183 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  25.59 
 
 		 1183 aa  70.5  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  32.03 
 
 		 1183 aa  70.1  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  32.03 
 
 		 1183 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  20.14 
 
 		 760 aa  67.8  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  31.97 
 
 		 1183 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  25 
 
 		 1183 aa  63.9  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  23.74 
 
 		 997 aa  61.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  28.42 
 
 		 1995 aa  59.3  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.27 
 
 		 825 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  28.24 
 
 		 814 aa  56.2  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  24.01 
 
 		 784 aa  55.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  26 
 
 		 1030 aa  54.3  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  38.54 
 
 		 993 aa  54.3  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  24.12 
 
 		 784 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  32.08 
 
 		 1137 aa  50.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  23.67 
 
 		 784 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  25.08 
 
 		 598 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  22.71 
 
 		 739 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  23.98 
 
 		 1283 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  28.24 
 
 		 902 aa  47  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  24.44 
 
 		 598 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.58 
 
 		 817 aa  45.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  30.3 
 
 		 806 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  25.16 
 
 		 217 aa  44.3  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>