73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4911 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 814 aa  1647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.11 
 
 		 823 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  37.77 
 
 		 781 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  32.06 
 
 		 993 aa  209  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.34 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  31.81 
 
 		 950 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  29.37 
 
 		 666 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.9 
 
 		 784 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  22.66 
 
 		 784 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  30.29 
 
 		 1089 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  29.01 
 
 		 1314 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  27.65 
 
 		 814 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  22.27 
 
 		 784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  30.43 
 
 		 599 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  24.96 
 
 		 916 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1528  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.01 
 
 		 625 aa  102  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.9 
 
 		 825 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.29 
 
 		 877 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  31.38 
 
 		 1030 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1557  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.6 
 
 		 722 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  24.73 
 
 		 651 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.44 
 
 		 719 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.61 
 
 		 817 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 735 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  21.88 
 
 		 714 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  49.21 
 
 		 733 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  21.57 
 
 		 877 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  26.48 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  32.93 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  21.18 
 
 		 1216 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4272  hypothetical protein  36.78 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  42.03 
 
 		 733 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  25.3 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  20.95 
 
 		 956 aa  57.8  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.3 
 
 		 1211 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0743  hypothetical protein  32.56 
 
 		 646 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.3 
 
 		 1211 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  27.67 
 
 		 1211 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  28.4 
 
 		 863 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  26.02 
 
 		 590 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  26.29 
 
 		 1183 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  23.95 
 
 		 1183 aa  52.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  32 
 
 		 781 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  23.95 
 
 		 1183 aa  52.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  32.14 
 
 		 811 aa  52.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  21.62 
 
 		 642 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  32.14 
 
 		 811 aa  52.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  29.09 
 
 		 1183 aa  52  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  30.92 
 
 		 647 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  19.79 
 
 		 739 aa  51.2  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  24.8 
 
 		 1183 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  29.85 
 
 		 1183 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  19.79 
 
 		 739 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  19.79 
 
 		 739 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  21.62 
 
 		 642 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  24.57 
 
 		 1183 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  22.15 
 
 		 824 aa  48.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  21.24 
 
 		 641 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.33 
 
 		 738 aa  47  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.93 
 
 		 760 aa  46.6  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  35.8 
 
 		 540 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1070 aa  47  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  25 
 
 		 1206 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  31.82 
 
 		 726 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  21.26 
 
 		 596 aa  45.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  18.42 
 
 		 680 aa  45.4  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  24.12 
 
 		 716 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  20.63 
 
 		 997 aa  45.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  22.55 
 
 		 2066 aa  45.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  22.55 
 
 		 2066 aa  45.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  24.55 
 
 		 919 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  36.11 
 
 		 959 aa  44.7  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  20.63 
 
 		 1078 aa  44.3  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>