59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3196 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 959 aa  1922    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  48.01 
 
 		 1032 aa  651    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  43.2 
 
 		 1025 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  42.8 
 
 		 1025 aa  355  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  42.42 
 
 		 1025 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  33.45 
 
 		 815 aa  333  9e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  40.04 
 
 		 971 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  39.26 
 
 		 971 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.4 
 
 		 815 aa  279  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  60.11 
 
 		 813 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  54.64 
 
 		 809 aa  199  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  53.55 
 
 		 361 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3484  putative tail protein from prophage; putative tail length tape measure motif protein  42.04 
 
 		 409 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0174075  hitchhiker  0.00423679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  46.96 
 
 		 935 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  46.41 
 
 		 935 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  26.69 
 
 		 1030 aa  157  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  24.21 
 
 		 877 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.42 
 
 		 877 aa  140  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  23.81 
 
 		 1216 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  32.66 
 
 		 459 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  28.6 
 
 		 550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4360  Phage-related minor tail protein-like  36.32 
 
 		 1206 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348966  normal  0.27157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  30.15 
 
 		 986 aa  115  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  26.9 
 
 		 877 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  23.13 
 
 		 1660 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  31.78 
 
 		 920 aa  110  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  29.59 
 
 		 919 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  33.14 
 
 		 887 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  30.29 
 
 		 737 aa  99.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  34.52 
 
 		 956 aa  91.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  47.83 
 
 		 701 aa  91.3  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  35.81 
 
 		 1078 aa  78.2  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  27.47 
 
 		 781 aa  75.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  26.53 
 
 		 858 aa  75.5  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  35.38 
 
 		 823 aa  72.4  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27.25 
 
 		 784 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  26.45 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  24.92 
 
 		 945 aa  68.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  24.92 
 
 		 945 aa  68.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  29.39 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  33.59 
 
 		 1183 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1206 aa  66.6  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  33.59 
 
 		 1183 aa  67  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  32.56 
 
 		 1183 aa  65.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  33.59 
 
 		 1183 aa  65.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  31.94 
 
 		 1183 aa  65.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  33.59 
 
 		 1183 aa  65.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.59 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  24.27 
 
 		 997 aa  61.6  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  26.54 
 
 		 824 aa  58.9  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.18 
 
 		 743 aa  55.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.96 
 
 		 825 aa  53.5  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  27.92 
 
 		 739 aa  51.6  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  19.41 
 
 		 760 aa  49.7  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  26.16 
 
 		 739 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  26.16 
 
 		 739 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  24.14 
 
 		 871 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  27.56 
 
 		 540 aa  45.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  21.59 
 
 		 814 aa  44.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>