64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1155 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  94.45 
 
 
739 aa  1386    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  94.45 
 
 
739 aa  1386    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 
739 aa  1491    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  34.82 
 
 
935 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  34.82 
 
 
935 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  32.85 
 
 
1025 aa  260  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  33.77 
 
 
1025 aa  257  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  33.58 
 
 
1025 aa  253  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  26.26 
 
 
680 aa  213  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  32.09 
 
 
550 aa  191  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  26.61 
 
 
738 aa  169  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  25.55 
 
 
641 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  25.55 
 
 
642 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.43 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  26.79 
 
 
714 aa  141  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  24.75 
 
 
642 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  27.35 
 
 
956 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.05 
 
 
817 aa  117  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  24.16 
 
 
997 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27.3 
 
 
784 aa  104  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  25.65 
 
 
793 aa  104  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  27.3 
 
 
784 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  28.75 
 
 
784 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.17 
 
 
877 aa  99.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  24.75 
 
 
651 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  24.48 
 
 
993 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.67 
 
 
781 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  21.89 
 
 
877 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.33 
 
 
825 aa  89  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  24.41 
 
 
666 aa  88.2  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.86 
 
 
823 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.64 
 
 
743 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  27.85 
 
 
824 aa  73.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  43.75 
 
 
887 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  22.58 
 
 
1030 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  27.65 
 
 
919 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.55 
 
 
1092 aa  68.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  27.62 
 
 
920 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  22.95 
 
 
907 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.7 
 
 
762 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  22.03 
 
 
781 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.15 
 
 
1095 aa  60.8  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.2 
 
 
950 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  28.24 
 
 
701 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.31 
 
 
1342 aa  57.4  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  28.97 
 
 
596 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3243  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.14 
 
 
1419 aa  52.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.948991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.17 
 
 
1628 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.98 
 
 
959 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  22.64 
 
 
1216 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.59 
 
 
1032 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  23.36 
 
 
814 aa  48.9  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3592  TP901 family phage tail tape measure protein  22.77 
 
 
1426 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0797  TP901 family phage tail tape measure protein  22.77 
 
 
1426 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.274443 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.82 
 
 
738 aa  47.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  22.44 
 
 
809 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  46.43 
 
 
540 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  26.09 
 
 
811 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  30.34 
 
 
726 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  26.09 
 
 
811 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  27.04 
 
 
921 aa  45.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  27.68 
 
 
590 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  23.79 
 
 
655 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  25.64 
 
 
656 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>