77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4387 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  75.06 
 
 		 815 aa  1168    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  75.52 
 
 		 809 aa  1170    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  76.42 
 
 		 459 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  100 
 
 		 813 aa  1635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  75.31 
 
 		 815 aa  1169    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  73.57 
 
 		 361 aa  492  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.16 
 
 		 959 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  30.85 
 
 		 1216 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  29.25 
 
 		 877 aa  263  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  32.3 
 
 		 971 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  31.96 
 
 		 971 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  26.21 
 
 		 956 aa  174  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  50.86 
 
 		 935 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  50.29 
 
 		 935 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  29.73 
 
 		 733 aa  158  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  27.39 
 
 		 1183 aa  144  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  26.25 
 
 		 1183 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  27.69 
 
 		 1183 aa  141  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  26.85 
 
 		 1183 aa  140  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  27.11 
 
 		 1183 aa  138  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  26.97 
 
 		 1183 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  26.75 
 
 		 1183 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  34.72 
 
 		 737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  37.23 
 
 		 1025 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  44.35 
 
 		 1032 aa  127  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  25.86 
 
 		 1549 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  34.91 
 
 		 1025 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  40.59 
 
 		 887 aa  121  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  37.58 
 
 		 1025 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  25.84 
 
 		 877 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  30.51 
 
 		 701 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  24.86 
 
 		 2066 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  24.86 
 
 		 2066 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  26.68 
 
 		 1178 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  37.5 
 
 		 919 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  38.65 
 
 		 920 aa  101  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  28.57 
 
 		 975 aa  97.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  33.33 
 
 		 863 aa  95.1  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  27.14 
 
 		 969 aa  93.2  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  28.5 
 
 		 986 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  31.34 
 
 		 914 aa  90.9  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  30.71 
 
 		 1297 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.45 
 
 		 1371 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  27.23 
 
 		 1127 aa  89  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.06 
 
 		 981 aa  77.4  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0253  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.02 
 
 		 617 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.57 
 
 		 1478 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  35.85 
 
 		 1078 aa  73.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.5 
 
 		 1343 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.88 
 
 		 1671 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.63 
 
 		 959 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.63 
 
 		 959 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  24.87 
 
 		 757 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.63 
 
 		 823 aa  62.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  23.08 
 
 		 945 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  23.08 
 
 		 945 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  26.12 
 
 		 921 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  24.02 
 
 		 1409 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  21.02 
 
 		 997 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  24.32 
 
 		 1030 aa  54.7  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05040  hypothetical protein  26.5 
 
 		 851 aa  54.3  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  20.27 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  23.42 
 
 		 1346 aa  54.3  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  20.38 
 
 		 760 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.66 
 
 		 1173 aa  53.5  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  23.49 
 
 		 1283 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.88 
 
 		 784 aa  51.2  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1041  probable tail length determinator  25.39 
 
 		 704 aa  50.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  30.1 
 
 		 784 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.15 
 
 		 1211 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  30.1 
 
 		 784 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  22.4 
 
 		 739 aa  49.3  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.75 
 
 		 1245 aa  48.5  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  21.09 
 
 		 987 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.91 
 
 		 1211 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  19.57 
 
 		 642 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  23.67 
 
 		 1211 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>