62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0550 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 969 aa  1881    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  25.96 
 
 		 1297 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.58 
 
 		 1371 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.15 
 
 		 1173 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  32.83 
 
 		 975 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  27.76 
 
 		 1178 aa  125  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  29.5 
 
 		 2066 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  29.5 
 
 		 2066 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  24.74 
 
 		 1549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.57 
 
 		 733 aa  111  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  29 
 
 		 1478 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.6 
 
 		 1343 aa  105  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  26.69 
 
 		 1127 aa  105  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  31.25 
 
 		 1216 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  29.93 
 
 		 971 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  28.21 
 
 		 1409 aa  98.2  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  28.57 
 
 		 971 aa  95.9  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  32.56 
 
 		 914 aa  95.5  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  27.46 
 
 		 813 aa  91.3  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  25.1 
 
 		 1346 aa  89.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  23.85 
 
 		 809 aa  87.4  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  26.79 
 
 		 1183 aa  87.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  27.09 
 
 		 1183 aa  86.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.95 
 
 		 1671 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  27.09 
 
 		 1183 aa  85.9  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  26.6 
 
 		 815 aa  85.9  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.1 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  26.85 
 
 		 1183 aa  85.5  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  26.68 
 
 		 1183 aa  84.7  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.6 
 
 		 815 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.9 
 
 		 959 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.9 
 
 		 959 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  36.7 
 
 		 1077 aa  80.9  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  29.27 
 
 		 759 aa  80.1  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  29.9 
 
 		 757 aa  80.1  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  26.6 
 
 		 1183 aa  77.8  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  26.37 
 
 		 1183 aa  77  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.53 
 
 		 981 aa  76.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  24.83 
 
 		 1283 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.85 
 
 		 936 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  35.29 
 
 		 318 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.89 
 
 		 936 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  22.42 
 
 		 737 aa  65.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  39.56 
 
 		 792 aa  63.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  22.65 
 
 		 1736 aa  63.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  27.86 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  29.53 
 
 		 858 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  19.66 
 
 		 1510 aa  58.9  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  19.66 
 
 		 1510 aa  58.9  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  22.19 
 
 		 921 aa  59.3  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  25.58 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  23.7 
 
 		 877 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  31.43 
 
 		 874 aa  55.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0596  prophage LambdaSa1, pblA protein, internal deletion  35.37 
 
 		 670 aa  53.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.48 
 
 		 738 aa  52  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1640  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.41 
 
 		 2757 aa  51.2  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  21.51 
 
 		 1120 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1089 aa  48.9  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  22.12 
 
 		 1211 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.12 
 
 		 1211 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.39 
 
 		 1211 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  37.68 
 
 		 1995 aa  45.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>