46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2253 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  94.39 
 
 		 642 aa  1182    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  94.67 
 
 		 641 aa  1179    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  100 
 
 		 642 aa  1284    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  40.89 
 
 		 651 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  54.64 
 
 		 956 aa  379  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  40.31 
 
 		 719 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  40.04 
 
 		 714 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.17 
 
 		 781 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  34.75 
 
 		 997 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  32.56 
 
 		 793 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  27.87 
 
 		 680 aa  169  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  33.52 
 
 		 738 aa  157  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  25.23 
 
 		 739 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  25.23 
 
 		 739 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  25.84 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  29.26 
 
 		 1025 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  29.26 
 
 		 1025 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  28.99 
 
 		 1025 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.51 
 
 		 1628 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  27.92 
 
 		 935 aa  90.5  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.93 
 
 		 1095 aa  89.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.11 
 
 		 1092 aa  88.6  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  27.64 
 
 		 935 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  25.61 
 
 		 550 aa  87  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.56 
 
 		 762 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  23.42 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1148  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.08 
 
 		 826 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.17 
 
 		 950 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  22.97 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  22.97 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  22.97 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  22.76 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.12 
 
 		 823 aa  57.4  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  20.25 
 
 		 733 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.43 
 
 		 825 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.87 
 
 		 1342 aa  51.6  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  21.62 
 
 		 814 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  26.57 
 
 		 781 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  20.7 
 
 		 877 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.89 
 
 		 815 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  21.89 
 
 		 815 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.73 
 
 		 805 aa  44.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  23.53 
 
 		 1127 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  21.43 
 
 		 590 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.24 
 
 		 817 aa  44.3  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  20.92 
 
 		 919 aa  43.9  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>