64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1327 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  100 
 
 
986 aa  1976    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  52.13 
 
 
919 aa  944    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  52.38 
 
 
920 aa  962    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  37.26 
 
 
887 aa  549  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  31.95 
 
 
956 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  32.93 
 
 
1078 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  40.44 
 
 
863 aa  131  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  32.75 
 
 
877 aa  127  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  37.25 
 
 
784 aa  101  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1491  hypothetical protein  23.93 
 
 
768 aa  101  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  31.38 
 
 
815 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  35.29 
 
 
784 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.38 
 
 
815 aa  100  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.15 
 
 
959 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  36.76 
 
 
784 aa  99.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  34.86 
 
 
1216 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6588  hypothetical protein  25.84 
 
 
668 aa  98.6  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  31.38 
 
 
361 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2478  hypothetical protein  23.21 
 
 
642 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  33.56 
 
 
971 aa  92  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  33.56 
 
 
971 aa  92.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  30.86 
 
 
935 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  28.49 
 
 
809 aa  91.3  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  30.86 
 
 
935 aa  91.3  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  38.79 
 
 
1032 aa  89.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  25 
 
 
1088 aa  85.5  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  27.37 
 
 
813 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.53 
 
 
823 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  26.67 
 
 
877 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.85 
 
 
760 aa  78.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.25 
 
 
825 aa  77  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  30.39 
 
 
945 aa  75.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  30.39 
 
 
945 aa  75.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  25.86 
 
 
1025 aa  70.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  38.46 
 
 
1089 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  24.86 
 
 
1025 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  25.43 
 
 
1025 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.96 
 
 
817 aa  66.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  27.08 
 
 
1030 aa  65.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  27.94 
 
 
550 aa  64.3  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  34.29 
 
 
993 aa  63.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  26.98 
 
 
739 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  26.98 
 
 
739 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  24.03 
 
 
1137 aa  59.3  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  33.66 
 
 
459 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  25.63 
 
 
739 aa  57.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  25.45 
 
 
737 aa  57  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  34.62 
 
 
1084 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2296  hypothetical protein  20.21 
 
 
613 aa  53.9  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  30.58 
 
 
693 aa  52.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  29.91 
 
 
1183 aa  52  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  29.91 
 
 
1183 aa  52  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  34.88 
 
 
786 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  28.12 
 
 
1995 aa  50.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  28.04 
 
 
1183 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  19.93 
 
 
997 aa  48.5  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  28.85 
 
 
1183 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  28.85 
 
 
1183 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  28.04 
 
 
1183 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  33.72 
 
 
871 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  27.88 
 
 
1183 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  32.29 
 
 
1155 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  32.29 
 
 
1155 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  25.57 
 
 
877 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>