59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1175 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 1343 aa  2690    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  42.23 
 
 		 1409 aa  226  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  38.95 
 
 		 1371 aa  207  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  31.85 
 
 		 2066 aa  152  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  31.85 
 
 		 2066 aa  152  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  30.06 
 
 		 1549 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  31.71 
 
 		 1127 aa  144  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  31.6 
 
 		 969 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.12 
 
 		 1173 aa  134  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4360  Phage-related minor tail protein-like  50.37 
 
 		 1206 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348966  normal  0.27157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.38 
 
 		 1478 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  28.97 
 
 		 1178 aa  119  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  27.58 
 
 		 975 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  30.06 
 
 		 1183 aa  109  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  35.48 
 
 		 1346 aa  109  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  29.19 
 
 		 1183 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  29.19 
 
 		 1183 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  29.19 
 
 		 1183 aa  108  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  29.02 
 
 		 1216 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.2 
 
 		 733 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  29.49 
 
 		 1183 aa  106  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  37.44 
 
 		 1283 aa  106  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  29.48 
 
 		 1183 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  29.74 
 
 		 1183 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  36.71 
 
 		 1671 aa  101  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  36.23 
 
 		 959 aa  99  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  36.23 
 
 		 959 aa  99  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  32.43 
 
 		 1297 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  36.32 
 
 		 914 aa  95.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  27.48 
 
 		 971 aa  94.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  26.97 
 
 		 987 aa  92.8  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  32.99 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  25.44 
 
 		 971 aa  84.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.07 
 
 		 877 aa  81.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.49 
 
 		 815 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  26.9 
 
 		 815 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  68.09 
 
 		 475 aa  74.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  26.9 
 
 		 809 aa  73.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  55.93 
 
 		 408 aa  70.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  27.18 
 
 		 757 aa  69.7  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.36 
 
 		 981 aa  65.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.96 
 
 		 1628 aa  61.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  24.35 
 
 		 1736 aa  57  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.79 
 
 		 733 aa  56.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.37 
 
 		 805 aa  55.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  24.02 
 
 		 813 aa  55.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  32.81 
 
 		 1078 aa  52.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  47.54 
 
 		 669 aa  51.6  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.91 
 
 		 1245 aa  51.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  45.83 
 
 		 1190 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  31.37 
 
 		 858 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  23.17 
 
 		 1120 aa  50.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1096 aa  48.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  23.74 
 
 		 877 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  24.1 
 
 		 596 aa  46.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  40.51 
 
 		 139 aa  46.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2149  hypothetical protein  37.31 
 
 		 152 aa  45.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  42.31 
 
 		 1222 aa  45.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  38.24 
 
 		 915 aa  45.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>