79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2303 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  94.03 
 
 		 971 aa  1764    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 971 aa  1966    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  33.78 
 
 		 1216 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  33.1 
 
 		 877 aa  320  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.5 
 
 		 959 aa  319  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  37.43 
 
 		 1025 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  38.97 
 
 		 1025 aa  290  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  47.88 
 
 		 935 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  47.42 
 
 		 935 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  35.69 
 
 		 1025 aa  269  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.1 
 
 		 815 aa  257  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  31.92 
 
 		 815 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  28.09 
 
 		 809 aa  248  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  32.26 
 
 		 813 aa  248  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  30.04 
 
 		 1549 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  36.47 
 
 		 1032 aa  188  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  26.04 
 
 		 877 aa  178  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  33.24 
 
 		 361 aa  162  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  25.36 
 
 		 1078 aa  150  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  24.59 
 
 		 2066 aa  148  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  24.59 
 
 		 2066 aa  148  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  24.17 
 
 		 1183 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  29.68 
 
 		 733 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  30.89 
 
 		 1127 aa  137  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  47.37 
 
 		 459 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  26.3 
 
 		 863 aa  132  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  24.81 
 
 		 1183 aa  131  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  24.31 
 
 		 1183 aa  131  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  24.44 
 
 		 1183 aa  128  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  24.08 
 
 		 1183 aa  128  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  27.56 
 
 		 1178 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  24.08 
 
 		 1183 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  24.05 
 
 		 1183 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  32.93 
 
 		 550 aa  123  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  36.18 
 
 		 757 aa  116  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  34 
 
 		 986 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  37.78 
 
 		 887 aa  112  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  32.91 
 
 		 956 aa  108  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  32 
 
 		 920 aa  105  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  32 
 
 		 919 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  26.43 
 
 		 975 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  27.56 
 
 		 701 aa  104  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  29.93 
 
 		 969 aa  100  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  28.86 
 
 		 1297 aa  98.2  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.11 
 
 		 1671 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.97 
 
 		 959 aa  94.7  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.97 
 
 		 959 aa  94.7  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  37.93 
 
 		 737 aa  93.6  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.76 
 
 		 1173 aa  83.2  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  32.04 
 
 		 914 aa  83.2  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.29 
 
 		 823 aa  78.2  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.83 
 
 		 1478 aa  77  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.73 
 
 		 936 aa  72.4  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  22.66 
 
 		 1346 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.49 
 
 		 936 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  22.24 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  23.14 
 
 		 1409 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  25.24 
 
 		 1283 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  27.73 
 
 		 858 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.44 
 
 		 1343 aa  65.1  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  23.95 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.15 
 
 		 1371 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  23.95 
 
 		 784 aa  62  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.95 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  24.88 
 
 		 997 aa  58.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.12 
 
 		 981 aa  58.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  26.07 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  22.6 
 
 		 739 aa  57.4  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  22.6 
 
 		 739 aa  57.4  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  19.83 
 
 		 760 aa  57.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  25.06 
 
 		 945 aa  55.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  25.06 
 
 		 945 aa  55.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  20.07 
 
 		 987 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  21.66 
 
 		 739 aa  52.4  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  27.35 
 
 		 759 aa  51.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.46 
 
 		 743 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  27.33 
 
 		 1030 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.73 
 
 		 817 aa  47.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0709  TP901 family phage tail tape measure protein  23.99 
 
 		 709 aa  45.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>