102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2891 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 
1216 aa  2449    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  39.18 
 
 
877 aa  539  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  34.6 
 
 
971 aa  355  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  34.2 
 
 
971 aa  355  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  30.5 
 
 
809 aa  280  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.11 
 
 
815 aa  279  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  30.79 
 
 
815 aa  275  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  33.83 
 
 
813 aa  249  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  32.64 
 
 
1549 aa  214  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  31.26 
 
 
1127 aa  208  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  30.78 
 
 
1178 aa  184  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  25.47 
 
 
956 aa  174  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  24.72 
 
 
2066 aa  171  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  24.72 
 
 
2066 aa  171  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.71 
 
 
733 aa  170  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  36.25 
 
 
975 aa  169  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  33.05 
 
 
361 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  26.8 
 
 
1183 aa  153  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  26.75 
 
 
1183 aa  152  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  26.81 
 
 
1183 aa  150  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.68 
 
 
959 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  26.68 
 
 
1183 aa  150  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  26.86 
 
 
1183 aa  149  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  26.7 
 
 
1183 aa  149  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  33.13 
 
 
920 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  27.26 
 
 
1183 aa  141  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  33.22 
 
 
887 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  33.55 
 
 
919 aa  137  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  26.19 
 
 
1297 aa  127  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  28.72 
 
 
986 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  27.22 
 
 
701 aa  112  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  26.35 
 
 
757 aa  111  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  29.2 
 
 
914 aa  109  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.64 
 
 
1173 aa  108  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  23.69 
 
 
877 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  34.81 
 
 
863 aa  103  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  31.25 
 
 
969 aa  102  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.24 
 
 
981 aa  102  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  31.63 
 
 
459 aa  101  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.84 
 
 
1032 aa  97.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.02 
 
 
1343 aa  97.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  27.83 
 
 
784 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  25.65 
 
 
987 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  27.83 
 
 
784 aa  86.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  26.17 
 
 
1078 aa  85.5  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.03 
 
 
1371 aa  85.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  21.29 
 
 
680 aa  85.5  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27.51 
 
 
784 aa  84  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  27.84 
 
 
935 aa  82.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  27.84 
 
 
935 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.71 
 
 
825 aa  79.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  26.57 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.27 
 
 
1478 aa  77.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  23.79 
 
 
759 aa  77.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  25.93 
 
 
1025 aa  74.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  22.08 
 
 
1120 aa  72.4  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.08 
 
 
817 aa  72  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  24.54 
 
 
1025 aa  68.9  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  39.77 
 
 
1025 aa  67  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.88 
 
 
738 aa  65.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.6 
 
 
1245 aa  66.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  21.97 
 
 
814 aa  65.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  24.06 
 
 
598 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  30.26 
 
 
925 aa  63.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  23.87 
 
 
598 aa  62.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  30.63 
 
 
596 aa  63.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  35.64 
 
 
1089 aa  62.4  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  23.24 
 
 
1409 aa  62.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  22.09 
 
 
739 aa  61.6  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  25.23 
 
 
605 aa  61.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  21.89 
 
 
907 aa  60.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  25.95 
 
 
590 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  21.06 
 
 
738 aa  58.9  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  32.48 
 
 
993 aa  58.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  26.86 
 
 
1137 aa  58.5  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.99 
 
 
805 aa  58.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.94 
 
 
760 aa  57  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  28.46 
 
 
590 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.94 
 
 
936 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.47 
 
 
936 aa  55.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.03 
 
 
719 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  21.66 
 
 
739 aa  53.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  21.66 
 
 
739 aa  53.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  21.46 
 
 
1736 aa  52.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  23.13 
 
 
945 aa  52.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  23.13 
 
 
945 aa  52.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  21.78 
 
 
1346 aa  52.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2149  hypothetical protein  39.06 
 
 
152 aa  52.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  43.14 
 
 
651 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  26.14 
 
 
921 aa  49.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  26.6 
 
 
714 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  25.14 
 
 
824 aa  49.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  32.32 
 
 
1030 aa  48.9  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  21.61 
 
 
1283 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  21.29 
 
 
997 aa  48.5  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  27.59 
 
 
540 aa  47  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  26.67 
 
 
693 aa  47.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  21.76 
 
 
1671 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.34 
 
 
1092 aa  45.8  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.27 
 
 
1095 aa  45.8  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>