39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2588 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 945 aa  1811    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 945 aa  1811    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  34.42 
 
 		 863 aa  349  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  33.5 
 
 		 1078 aa  271  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  30.19 
 
 		 877 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  32.77 
 
 		 596 aa  193  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.51 
 
 		 733 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  32.37 
 
 		 920 aa  95.5  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.76 
 
 		 877 aa  92.8  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  32.24 
 
 		 919 aa  92  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  24.28 
 
 		 1025 aa  91.3  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  24.46 
 
 		 1025 aa  88.2  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  24.53 
 
 		 1025 aa  87.4  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  28.35 
 
 		 986 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  25.34 
 
 		 956 aa  77.8  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  30.39 
 
 		 1030 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  27.92 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.92 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.92 
 
 		 959 aa  64.7  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  28.98 
 
 		 1216 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  25.99 
 
 		 813 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  32.48 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  30.49 
 
 		 887 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  25.29 
 
 		 809 aa  61.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  27.92 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  30.94 
 
 		 1183 aa  58.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  24.96 
 
 		 1183 aa  57.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  30.94 
 
 		 1183 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  30.37 
 
 		 1183 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  29.5 
 
 		 1183 aa  55.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  24.96 
 
 		 1183 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  23.65 
 
 		 971 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  30.37 
 
 		 1183 aa  53.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  23.04 
 
 		 971 aa  53.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  35.38 
 
 		 935 aa  51.2  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  35.38 
 
 		 935 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  19.65 
 
 		 760 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  26.05 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  26.05 
 
 		 784 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>