28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0253 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0253  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 617 aa  1253    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  36.2 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  36.04 
 
 		 598 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  30.07 
 
 		 684 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  30.07 
 
 		 684 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  32.24 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  31.41 
 
 		 590 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0709  TP901 family phage tail tape measure protein  31.7 
 
 		 709 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  27.27 
 
 		 656 aa  210  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  27.79 
 
 		 655 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1041  probable tail length determinator  30.09 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  30.16 
 
 		 605 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05040  hypothetical protein  30.8 
 
 		 851 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  27.12 
 
 		 656 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0910  TP901 family phage tail tape measure protein  29.72 
 
 		 658 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0574  TP901 family phage tail tape measure protein  25.39 
 
 		 731 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0262287  normal  0.426184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  26.89 
 
 		 1211 aa  104  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.89 
 
 		 1211 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.59 
 
 		 1211 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.75 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  24.79 
 
 		 809 aa  65.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.14 
 
 		 733 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  23.59 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.45 
 
 		 815 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  22.94 
 
 		 815 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1496  hypothetical protein  22.18 
 
 		 234 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  0.205956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  22.92 
 
 		 813 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  23.72 
 
 		 919 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>