54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2753 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  96.2 
 
 
1025 aa  1859    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 
1025 aa  2045    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  94.54 
 
 
1025 aa  1799    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  71.61 
 
 
935 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  71.61 
 
 
935 aa  789    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  76.36 
 
 
550 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  42.89 
 
 
959 aa  360  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  31.5 
 
 
971 aa  360  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  37.43 
 
 
971 aa  300  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  32.58 
 
 
739 aa  292  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  32.58 
 
 
739 aa  290  8e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  32.58 
 
 
739 aa  290  8e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  30.74 
 
 
877 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  28.43 
 
 
956 aa  183  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  26.16 
 
 
1078 aa  150  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.28 
 
 
1032 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  40.54 
 
 
815 aa  145  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.46 
 
 
815 aa  141  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  24.3 
 
 
680 aa  139  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  40.54 
 
 
459 aa  139  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  41.34 
 
 
809 aa  138  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  29.52 
 
 
642 aa  131  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  30.32 
 
 
641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  25.38 
 
 
738 aa  126  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  29.26 
 
 
642 aa  125  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  24.12 
 
 
997 aa  124  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  37.42 
 
 
813 aa  124  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  26.33 
 
 
863 aa  117  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.31 
 
 
877 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  45.19 
 
 
701 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  29.7 
 
 
919 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  24.73 
 
 
651 aa  98.2  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.97 
 
 
781 aa  92  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  28.71 
 
 
920 aa  92  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  31.32 
 
 
737 aa  87.8  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  25.57 
 
 
714 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.42 
 
 
762 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.42 
 
 
719 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  31.28 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  29.38 
 
 
793 aa  79  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.93 
 
 
823 aa  77.8  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  24.04 
 
 
781 aa  77.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  34.62 
 
 
887 aa  74.7  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  24.86 
 
 
986 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  23.41 
 
 
945 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  23.41 
 
 
945 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  23.7 
 
 
1216 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  29.91 
 
 
858 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  22.88 
 
 
1030 aa  63.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.81 
 
 
817 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  30.89 
 
 
784 aa  53.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  30.89 
 
 
784 aa  53.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  30.89 
 
 
784 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.04 
 
 
743 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>