54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2489 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  96.78 
 
 		 1025 aa  1863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  94.54 
 
 		 1025 aa  1821    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  67.73 
 
 		 935 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  67.58 
 
 		 935 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1025 aa  2045    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  76.36 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  42.48 
 
 		 959 aa  357  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  30.71 
 
 		 971 aa  355  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  37.24 
 
 		 971 aa  296  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  32.99 
 
 		 739 aa  288  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  32.99 
 
 		 739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  32.99 
 
 		 739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  31.7 
 
 		 877 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  27.29 
 
 		 956 aa  194  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.46 
 
 		 1032 aa  152  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  42.86 
 
 		 815 aa  145  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  40.99 
 
 		 815 aa  140  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  25.39 
 
 		 1078 aa  139  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  41.98 
 
 		 459 aa  139  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  41.9 
 
 		 809 aa  137  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  23.75 
 
 		 680 aa  137  9e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  29.26 
 
 		 642 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  30.05 
 
 		 641 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  38.04 
 
 		 813 aa  126  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  28.99 
 
 		 642 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  24.49 
 
 		 738 aa  122  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  24.92 
 
 		 997 aa  121  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  25.13 
 
 		 863 aa  121  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.19 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  43.38 
 
 		 701 aa  105  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  24.47 
 
 		 651 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  35.96 
 
 		 887 aa  92.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.67 
 
 		 781 aa  92  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  21.6 
 
 		 1216 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  29.31 
 
 		 737 aa  90.1  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  28.71 
 
 		 919 aa  89.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.42 
 
 		 762 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  27.49 
 
 		 920 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  25.74 
 
 		 714 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.56 
 
 		 719 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  29.38 
 
 		 793 aa  79  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.14 
 
 		 823 aa  75.5  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  27.01 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  30.17 
 
 		 361 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  25.86 
 
 		 986 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  30.34 
 
 		 858 aa  65.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  23.79 
 
 		 945 aa  63.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  23.79 
 
 		 945 aa  63.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.59 
 
 		 743 aa  51.2  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25 
 
 		 817 aa  49.7  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  22.01 
 
 		 1030 aa  48.5  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  31.33 
 
 		 784 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  31.33 
 
 		 784 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  45 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>