62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1133 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  100 
 
 		 739 aa  1487    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  100 
 
 		 739 aa  1487    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  94.45 
 
 		 739 aa  1386    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  34.36 
 
 		 935 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  34.36 
 
 		 935 aa  267  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  32.85 
 
 		 1025 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  33.28 
 
 		 1025 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  33.58 
 
 		 1025 aa  251  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  26.7 
 
 		 680 aa  218  5e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  31.4 
 
 		 550 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  28.07 
 
 		 738 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  25 
 
 		 641 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  25 
 
 		 642 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.19 
 
 		 719 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  27.2 
 
 		 714 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  24.22 
 
 		 642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  27.82 
 
 		 956 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.05 
 
 		 817 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  25.15 
 
 		 997 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  27.95 
 
 		 793 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  26.54 
 
 		 651 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.47 
 
 		 781 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27 
 
 		 784 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  27 
 
 		 784 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  28.44 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  25.14 
 
 		 993 aa  99.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.99 
 
 		 877 aa  97.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.19 
 
 		 743 aa  92  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  21.58 
 
 		 877 aa  80.9  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  31.21 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.55 
 
 		 825 aa  77.8  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.84 
 
 		 823 aa  77.4  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  27.31 
 
 		 919 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  29.06 
 
 		 920 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.66 
 
 		 1092 aa  71.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  32.46 
 
 		 824 aa  70.1  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  41.96 
 
 		 887 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  23.45 
 
 		 781 aa  68.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.37 
 
 		 1095 aa  68.6  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.8 
 
 		 950 aa  66.6  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.47 
 
 		 1628 aa  63.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.7 
 
 		 762 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.42 
 
 		 1342 aa  62.4  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  23.55 
 
 		 907 aa  62  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  28.24 
 
 		 701 aa  60.1  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  22.16 
 
 		 1030 aa  58.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  30.84 
 
 		 596 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  23.9 
 
 		 590 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3243  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.52 
 
 		 1419 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.948991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3592  TP901 family phage tail tape measure protein  23.49 
 
 		 1426 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0797  TP901 family phage tail tape measure protein  23.49 
 
 		 1426 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.274443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0910  TP901 family phage tail tape measure protein  23.74 
 
 		 658 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.7 
 
 		 1032 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  26.32 
 
 		 656 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  19.86 
 
 		 814 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.79 
 
 		 959 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  22.5 
 
 		 971 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  25.7 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  26.69 
 
 		 986 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  24.26 
 
 		 656 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  25.71 
 
 		 1216 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  26.23 
 
 		 921 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>