59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3322 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  100 
 
 		 743 aa  1451    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  47.43 
 
 		 781 aa  611  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  35.08 
 
 		 993 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.88 
 
 		 950 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  35.34 
 
 		 814 aa  187  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.04 
 
 		 823 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1557  Phage tail tape measure protein TP901, core region  35.44 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  30.85 
 
 		 599 aa  131  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1528  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.72 
 
 		 625 aa  122  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  33.81 
 
 		 666 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  37.34 
 
 		 858 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  28.14 
 
 		 814 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  24.44 
 
 		 916 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.78 
 
 		 817 aa  102  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.64 
 
 		 784 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  24.49 
 
 		 1089 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  20.54 
 
 		 680 aa  92.8  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  23.72 
 
 		 784 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  25.19 
 
 		 739 aa  91.3  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  25.19 
 
 		 739 aa  91.3  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  23.79 
 
 		 1314 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  22.88 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.87 
 
 		 825 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  24.11 
 
 		 739 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0743  hypothetical protein  27.89 
 
 		 646 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.3 
 
 		 1032 aa  70.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  29.22 
 
 		 902 aa  69.3  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  24.79 
 
 		 1025 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.68 
 
 		 959 aa  65.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  24.85 
 
 		 735 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  24.52 
 
 		 1025 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  23.67 
 
 		 793 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  24.79 
 
 		 1025 aa  59.7  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  26.72 
 
 		 1030 aa  58.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  40.22 
 
 		 974 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  26.17 
 
 		 971 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  26.02 
 
 		 919 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  23.19 
 
 		 877 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1604  hypothetical protein  35.9 
 
 		 134 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  38.53 
 
 		 957 aa  55.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  22.65 
 
 		 935 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  22.65 
 
 		 935 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  25.46 
 
 		 971 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  23.04 
 
 		 2066 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  23.04 
 
 		 2066 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  21.68 
 
 		 651 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.69 
 
 		 719 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  26.34 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  24.9 
 
 		 920 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.39 
 
 		 815 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  38.75 
 
 		 191 aa  47.8  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  25.69 
 
 		 815 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  26.17 
 
 		 714 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  26 
 
 		 459 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  21.75 
 
 		 738 aa  45.8  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  27.55 
 
 		 775 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0691  phage tail tape measure family protein  23.29 
 
 		 583 aa  43.9  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0746  phage tail tape measure family protein  23.29 
 
 		 583 aa  43.9  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  21.04 
 
 		 997 aa  43.9  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>