27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2598 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1299    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  28.61 
 
 		 759 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  37.89 
 
 		 907 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.37 
 
 		 805 aa  120  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  26.17 
 
 		 911 aa  107  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  35.39 
 
 		 807 aa  99.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  34.38 
 
 		 762 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  35.33 
 
 		 818 aa  97.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  36.36 
 
 		 852 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  32.14 
 
 		 806 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.95 
 
 		 738 aa  73.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1206 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  31.49 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  31.06 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  20.73 
 
 		 1510 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  20.73 
 
 		 1510 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  31.1 
 
 		 1283 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1070 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  28.39 
 
 		 1660 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  31.41 
 
 		 1566 aa  55.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  28.68 
 
 		 1346 aa  53.9  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  31.49 
 
 		 1030 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  31.18 
 
 		 1178 aa  51.2  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  23.37 
 
 		 550 aa  50.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  32.74 
 
 		 814 aa  50.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.84 
 
 		 1092 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.21 
 
 		 877 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>