31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0965 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  100 
 
 		 1070 aa  2131    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  29.38 
 
 		 1566 aa  225  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  28.57 
 
 		 841 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  28.57 
 
 		 841 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  26.88 
 
 		 1311 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  26.88 
 
 		 1311 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  25.34 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2598  hypothetical protein  26.26 
 
 		 647 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3667  hypothetical protein  37.78 
 
 		 191 aa  65.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  21.26 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  21.26 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  21.73 
 
 		 726 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  23.47 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  27.68 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  22.53 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  34.57 
 
 		 1077 aa  57.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  23.71 
 
 		 911 aa  57  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.54 
 
 		 738 aa  54.7  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  31.25 
 
 		 814 aa  54.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  24.22 
 
 		 1347 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  25.15 
 
 		 807 aa  53.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  33.66 
 
 		 1030 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  21.28 
 
 		 1206 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  26.92 
 
 		 1347 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.32 
 
 		 805 aa  49.3  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  32.17 
 
 		 1216 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  25.22 
 
 		 824 aa  47.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  20.27 
 
 		 805 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  24.05 
 
 		 1510 aa  44.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  24.05 
 
 		 1510 aa  44.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>