75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6196 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  100 
 
 		 759 aa  1484    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.3 
 
 		 1478 aa  158  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  29.87 
 
 		 2066 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  29.87 
 
 		 2066 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  28.95 
 
 		 1549 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  25.98 
 
 		 1127 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  25.27 
 
 		 1671 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  27.9 
 
 		 1178 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.39 
 
 		 877 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.37 
 
 		 733 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.19 
 
 		 1173 aa  107  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.84 
 
 		 959 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.84 
 
 		 959 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.65 
 
 		 1343 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  23.11 
 
 		 1216 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  25.42 
 
 		 1346 aa  98.2  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  28.11 
 
 		 969 aa  94.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.19 
 
 		 1297 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  25.58 
 
 		 1183 aa  91.3  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  25.71 
 
 		 1183 aa  90.9  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  24.82 
 
 		 1183 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  25.62 
 
 		 1183 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  24.82 
 
 		 1183 aa  88.6  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  23.19 
 
 		 1283 aa  87.8  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  26.5 
 
 		 1183 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  27.63 
 
 		 1183 aa  87.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  28.21 
 
 		 1409 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.82 
 
 		 1371 aa  81.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  25.5 
 
 		 971 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  29.71 
 
 		 914 aa  71.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  21.4 
 
 		 1510 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  21.4 
 
 		 1510 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.48 
 
 		 981 aa  69.7  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  25.71 
 
 		 971 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  24.57 
 
 		 975 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  46.25 
 
 		 993 aa  65.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  24.91 
 
 		 920 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  24.08 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  24.08 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  23.51 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  23.38 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.66 
 
 		 1245 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  23.43 
 
 		 863 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  24.56 
 
 		 877 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  21.19 
 
 		 907 aa  55.8  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.36 
 
 		 936 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0659  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.59 
 
 		 936 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  20.28 
 
 		 987 aa  55.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  21.88 
 
 		 911 aa  55.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  26.23 
 
 		 815 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  27.64 
 
 		 950 aa  54.3  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.48 
 
 		 805 aa  53.9  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  32.52 
 
 		 871 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  34.75 
 
 		 757 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  21.19 
 
 		 1120 aa  53.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  28.83 
 
 		 786 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  24.57 
 
 		 877 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  26.1 
 
 		 721 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  31.33 
 
 		 956 aa  51.2  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  24.86 
 
 		 887 aa  51.2  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.71 
 
 		 815 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  21.63 
 
 		 318 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  23.47 
 
 		 1137 aa  49.7  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  27.94 
 
 		 1078 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  23.32 
 
 		 605 aa  49.3  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  33.75 
 
 		 1084 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  23.17 
 
 		 762 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  24.1 
 
 		 716 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  24.25 
 
 		 852 aa  47.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  25.08 
 
 		 598 aa  47.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  25.08 
 
 		 598 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  24.6 
 
 		 809 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  23.31 
 
 		 759 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  27.88 
 
 		 818 aa  44.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  22.52 
 
 		 726 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>