48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0533 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  100 
 
 		 1077 aa  2086    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  27.46 
 
 		 792 aa  128  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  33.16 
 
 		 318 aa  104  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  21.69 
 
 		 1297 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  26.74 
 
 		 841 aa  92.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  26.74 
 
 		 841 aa  92.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  24.17 
 
 		 1137 aa  84.3  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1089 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  21.89 
 
 		 1510 aa  83.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  21.89 
 
 		 1510 aa  83.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  36.7 
 
 		 969 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  29.6 
 
 		 767 aa  75.1  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  25.27 
 
 		 1311 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  24.58 
 
 		 759 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  25.27 
 
 		 1311 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  21.68 
 
 		 989 aa  72  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3249  hypothetical protein  26.87 
 
 		 602 aa  72  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  21.68 
 
 		 989 aa  72  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  20.78 
 
 		 737 aa  63.9  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.11 
 
 		 805 aa  64.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  22.71 
 
 		 807 aa  63.9  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1070 aa  62.4  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  19.73 
 
 		 874 aa  62.4  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  22.28 
 
 		 1347 aa  62  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  24.37 
 
 		 806 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  17.44 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  17.44 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  18.09 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  23.19 
 
 		 1347 aa  59.3  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0596  prophage LambdaSa1, pblA protein, internal deletion  28.57 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  18.13 
 
 		 726 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  22.58 
 
 		 871 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  19.74 
 
 		 975 aa  55.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  22.37 
 
 		 786 aa  54.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  25.11 
 
 		 852 aa  54.3  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  19.78 
 
 		 805 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  20.61 
 
 		 911 aa  52.4  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  18.31 
 
 		 1206 aa  51.6  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  20.87 
 
 		 1216 aa  50.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  24.12 
 
 		 762 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  22.27 
 
 		 1155 aa  50.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  22.27 
 
 		 1155 aa  50.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  19.35 
 
 		 716 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  21.59 
 
 		 877 aa  49.3  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  25.56 
 
 		 959 aa  48.1  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  23.01 
 
 		 818 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.57 
 
 		 817 aa  45.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.44 
 
 		 738 aa  44.7  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>