30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3035 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3282  Phage-related protein-like protein  98.81 
 
 
841 aa  1653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3035  Phage-related protein-like protein  100 
 
 
841 aa  1669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.716589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  37.24 
 
 
759 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3894  hypothetical protein  33.92 
 
 
1925 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1269  hypothetical protein  32.37 
 
 
1925 aa  138  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  37.38 
 
 
1070 aa  128  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  35.62 
 
 
1311 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  35.62 
 
 
1311 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3667  hypothetical protein  42.53 
 
 
191 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  26.74 
 
 
1077 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2825  hypothetical protein  27.05 
 
 
818 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.816361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  25.34 
 
 
806 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  37.65 
 
 
318 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  36.78 
 
 
767 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  25 
 
 
1347 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  23.45 
 
 
1347 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  21.78 
 
 
907 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3900  hypothetical protein  26.99 
 
 
966 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.048265 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.1 
 
 
805 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  23.33 
 
 
811 aa  51.6  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  23.33 
 
 
811 aa  51.6  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  23.62 
 
 
1510 aa  51.6  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  23.62 
 
 
1510 aa  51.6  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  24.43 
 
 
975 aa  49.3  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  23.55 
 
 
726 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  19 
 
 
1137 aa  46.6  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  22.29 
 
 
1216 aa  44.7  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  22.74 
 
 
716 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  20.79 
 
 
807 aa  44.3  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  24.76 
 
 
1448 aa  44.3  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>